Araştırma Çıktıları / Research Outcomes

Permanent URI for this communityhttps://acikarsiv.thk.edu.tr/handle/123456789/2548

Browse

Filter results by typing the first few letters
Now showing 1 - 1 of 1
  • Thumbnail Image
    Publication
    Peptit Amfifillerin Kendiliğinden-Toplanma Mekanizmasının Moleküler Dinamik Yöntemleri ile İncelenmesi
    (2014) -- Emine Deniz TEKİN; Boş Türk Hava Kurumu Üniversitesi, Hava Ulaştırma Fakültesi, Pilotaj Bölümü
    “Kendiliğinden-Toplanma” (Self-Assembly) molekül düzeyinden galaksilere kadar, organik/inorganik nesnelerde, yapısal organizasyonu oluşturan en temel mekanizmadır. Moleküler nanoteknoloji, doğada pek çok karmaşık sistemin temelinde yatan bu özelliği kullanarak rejeneratif tıp, optik ve elektronik uygulamaları için gerekli olan malzemeleri üretmeyi hedeflemektedir. Bu projenin konusu olan “peptit amfifiller” kendiliğinden-toplanma mekanizması ile 1-boyutlu nanoyapıları oluşturmaktadırlar. Oluşan bu nanoyapılar, rejeneratif tıp ve doku mühendisliği çerçevesinde kan damarı yapımı ve hücre dışı matrisi (Extra Cellular Matrix, ECM) taklit edebilecek doku iskelesi (yapay hücre dışı matris) geliştirilmesinde kullanılma potansiyeline sahiptirler. Doku iskelesi üretiminde kullanılacak malzemenin biyo-uyumlu, biyo-bozunur ve gözenekli yapıda olmasının yanı sıra parçalanırken de zehirli ürünler oluşturmaması gerekmektedir. Bu özelliklere sahip malzemeler arasında peptit amfifil tabanlı nanolifler, diğer materyallere (doğal polimerler, biyo-seramikler ve bunların bileşiminden oluşan kompozit malzemeler) kıyasla doğal ECM’ nin yapısını ve biyolojik işlevini daha iyi taklit etmektedir. Projede, moleküler dinamik yöntemiyle, peptit amfifillerden oluşan silindirik nanoliflerin yapısal özelliklerinin detaylı bir şekilde araştırılması ve kendiliğinden-toplanma sürecinin temelinin anlaşılması hedeflenmektedir. Moleküler dinamik yönteminin, büyük biyomoleküllerin dinamiğinin anlaşılmasında yararlı olduğu bilinmektedir. Yine aynı yöntem kullanılarak, “kendiliğinden toplanma” sürecinin meydana geldiği koşulların (örneğin ortamın pH değeri, sıcaklığı) değiştirilmesinin, ortaya çıkacak supramoleküler nanoyapıların şekil ve özellikleri (örneğin sertliği) üzerindeki etkisi ile bu süreçte moleküler etkileşimlerin rolü araştırılacaktır.